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        多肽合成
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        荧光标记多肽

         荧光染料光谱列表
        染料名称 Excitation(nm) Emission(nm) 分子量 备注信息
        Reactive and conjugated probes
        Hydroxycoumarin 325 386 331 Succinimidyl ester
        Aminocoumarin 350 445 330 Succinimidyl ester
        Methoxycoumarin 360 410 317 Succinimidyl ester
        Cascade Blue (375);401 423 596 Hydrazide
        Pacific Blue 403 455 406 Maleimide
        Pacific Orange 403 551    
        Lucifer yellow 425 528    
        NBD 466 539 294 NBD-X
        R-Phycoerythrin (PE) 480;565 578 240k  
        PE-Cy5 conjugates 480;565;650 670   aka Cychrome, R670, Tri-Color,
        Quantum Red
        PE-Cy7 conjugates 480;565;743 767    
        Red 613 480;565 613   PE-Texas Red
        PerCP 490 675   Peridinin chlorphyll protein
        TruRed 490,675 695   PerCP-Cy5.5 conjugate
        FluorX 494 520 587 GE Healthcare
        Fluorescein 495 519 389 FITC; pH sensitive
        BODIPY-FL 503 512    
        TRITC 547 572 444 TRITC
        X-Rhodamine 570 576 548 XRITC
        Lissamine Rhodamine B 570 590    
        Texas Red 589 615 625 Sulfonyl chloride
        Allophycocyanin (APC) 650 660 104k  
        APC-Cy7 conjugates 650;755 767   PharRed
        Alexa Fluor系列荧光染料
        Alexa Fluor 350 343 442 410  
        Alexa Fluor 405 401 421 1028  
        Alexa Fluor 430 434 540 702  
        Alexa Fluor 488 499 519 643 QY 0.92
        Alexa Fluor 500 503 525 700  
        Alexa Fluor 514 517 542 714  
        Alexa Fluor 532 530 555 724 QY 0.61
        Alexa Fluor 546 561 572 1079 QY 0.79
        Alexa Fluor 555 553 568 1250 QY 0.1
        Alexa Fluor 568 579 603 792 QY 0.69
        Alexa Fluor 594 591 618 820 QY 0.66
        Alexa Fluor 610 610 629 1285  
        Alexa Fluor 633 632 648 1200  
        Alexa Fluor 647 652 668 1300 QY 0.33
        Alexa Fluor 660 663 691 1100  
        Alexa Fluor 680 680 702 1150  
        Alexa Fluor 700 696 719 1400  
        Alexa Fluor 750 752 776 1300  
        Alexa Fluor 790 782 804 1750  
        Cy系列荧光染料
        Cy2 489 506 714 QY 0.12
        Cy3 (512);550 570;(615) 767 QY 0.15
        Cy3B 558 572;(620) 658 QY 0.67
        Cy3.5 581 594;(640) 1102 QY 0.15
        Cy5 (625);650 670 792 QY 0.28
        Cy5.5 675 694 1128 QY 0.23
        Cy7 743 767 818 QY 0.28
        核酸相关探针染料
        Hoechst 33342 343 483 616 AT-selective
        DAPI 345 455   AT-selective
        Hoechst 33258 345 478 624 AT-selective
        SYTOX Blue 431 480 ~400 DNA
        Chromomycin A3 445 575   CG-selective
        Mithramycin 445 575    
        YOYO-1 491 509 1271  
        Ethidium Bromide 493 620 394  
        Acridine Orange 503 530/640   DNA/RNA
        SYTOX Green 504 523 ~600 DNA
        TOTO-1, TO-PRO-1 509 533   Vital stain, TOTO: Cyanine Dimer
        TO-PRO: Cyanine Monomer
        Thiazole Orange 510 530    
        Propidium Iodide (PI) 536 617 668.4  
        LDS 751 543;590 712;607 472 DNA (543ex/712em), RNA (590ex/607em)
        7-AAD 546 647   7-aminoactinomycin D, CG-selective
        SYTOX Orange 547 570 ~500 DNA
        TOTO-3, TO-PRO-3 642 661    
        DRAQ5 647 681,697 413 usable excitation down to 488
        细胞功能探针
        Indo-1 361/330 490/405 1010 AM ester. Low/High Ca++,
        Fluo-3 506 526 855 AM ester. pH > 6
        DCFH 505 535 529 2'7'Dichorodihydrofluorescein, oxidized form
        DHR 505 534 346 Dihydrorhodamine 123, oxidized form,
        light catalyzes oxidation
        SNARF 548/579 587/635   pH 6/9
        荧光蛋白
                QY BR PS  
        Y66H 360 442          
        Y66F 360 508          
        EBFP 380 440   0.18 0.27   monomer
        EBFP2 383 448     20   monomer
        Azurite 383 447     15   monomer
        GFPuv 385 508          
        T-Sapphire 399 511   0.60 26 25 weak dimer
        Cerulean 433 475   0.62 27 36 weak dimer
        mCFP 433 475   0.40 13 64 monomer
        ECFP 434 477   0.15 3    
        CyPet 435 477   0.51 18 59 weak dimer
        Y66W 436 485          
        mKeima-Red 440 620   0.24 3   monomer
        TagCFP 458 480     29   dimer
        AmCyan1 458 489   0.75 29   tetramer
        mTFP1 462 492     54   dimer
        S65A 471 504          
        Midoriishi Cyan 472 495   0.9 25   dimer
        Wild Type GFP 396,475 508 26k 0.77      
        S65C 479 507          
        TurboGFP 482 502 26 k 0.53 37   dimer
        TagGFP 482 505     34   monomer
        S65L 484 510          
        Emerald 487 509   0.68 39 0.69 weak dimer; (Invitrogen)
        S65T 488 511          
        EGFP 488 507 26k 0.60 34 174 weak dimer
        Azami Green 492 505   0.74 41   monomer
        ZsGreen1 493 505 105k 0.91 40   tetramer
        TagYFP 508 524     47   monomer
        EYFP 514 527 26k 0.61 51 60 weak dimer
        Topaz 514 527     57   monomer
        Venus 515 528   0.57 53 15 weak dimer
        mCitrine 516 529   0.76 59 49 monomer
        YPet 517 530   0.77 80 49 weak dimer
        TurboYFP 525 538 26 k 0.53 1.65   dimer
        ZsYellow1 529 539   0.65 13   tetramer
        Kusabira Orange 548 559   0.60 31   monomer
        mOrange 548 562   0.69 49 9 monomer
        mKO 548 559   0.60 31 122 monomer
        TurboRFP 553 574 26 k 0.67 62   dimer
        tdTomato 554 581   0.69 95 98 tandem dimer
        TagRFP 555 584     50   monomer
        DsRed monomer 556 586 ~28k 0.1 3.5 16 monomer
        DsRed2 ("RFP") 563 582 ~110k 0.55 24    
        mStrawberry 574 596   0.29 26 15 monomer
        TurboFP602 574 602 26 k 0.35 26   dimer
        AsRed2 576 592 ~110k 0.21 13   tetramer
        mRFP1 584 607 ~30k 0.25     monomer
        J-Red 584 610   0.20 8.8 13 dimer
        mCherry 587 610   0.22 16 96 monomer
        HcRed1 588 618 ~52k 0.03 0.6   dimer
        Katusha 588 635     23   dimer
        mKate (TagFP635) 588 635     15   monomer
        TurboFP635 588 635 26 k 0.34 22   dimer
        mPlum 590 649   0.10 4.1 53  
        mRaspberry 598 625   0.15 13   monomer; faster photobleach than mPlum
        其他探针
        Monochlorobimane 380 461 226 Glutathione probe
        Calcein 496 517 623 pH > 5
                                                        
        单荧光修饰

        N端、Lys或Cys巯基: FAM、FITC、TAMRA、Bodipy、Cy5、Cy7
        N端或Lys侧链: DansylChlorde、Mca、Dabcyl、Dnp、CarboxyRhodamine110、7OHCCA、Tide Fluor 系列、Alexa Fluor 系列、Texas Red、QSY系列、Atto 系列
        Cys巯基:DACIA、Farnesyl
        Glu、Asp侧链或者C端:Edans

        双荧光修饰 (FRET peptide)
        Dabcyl+Edans             Mca+Dnp              FITC+5FAM              5FAM+TQ2      
        Cy5+QSY21                6FAM+QSY9         5TAMRA+QSY7       DNP+DACIA
        5FAM+Farnesyl          Tide Fluor 555+Tide Fluor 647                Tide Fluor 488+Tide Flour550


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